当前，高等教育事业发展正处在新的历史起点上，迫切需要推进高校管理体制改革，通过“遵循教育规律、转变发展方式、提升管理效能”这一指导思想，科学设计技术路径，充分发挥高校自主性和创造性。

　　改革行政管理，合理配置资源 

　　推进高等教育行政管理改革，要进一步合理配置高等教育资源，着力构建有利于高校合理定位、特色发展的分类管理体系和财政拨款机制。

　　省级政府主管高等教育，中央政府实施宏观统筹管理。实行这一体制，关键是要做到“三个落实”：一是落实中央政府和省级政府的权责边界。中央政府统一领导和管理国家教育事业，侧重于制定发展规划、方针政策、基本标准、宏观统筹和奖优补缺等。省级政府主要履行统筹规划、政策引导、监督管理和提供公共服务等职责。二是落实省级政府的高校设置和调整权。三是落实区域高等教育资源配置权。对部属高校逐步实行由部管为主向部省共建转变，并强化省级政府管理权，增强区域高等教育体系的互补性和协调性。

　　加强政策引导和扶持，形成优化合理的布局结构。高等教育行政管理改革的一个重要方面是合理配置资源，促进高等教育发展与未来技术更新、经济发展方式转变、区域经济发展大格局相适应。类似要求在我国环渤海地区、长三角地区、珠三角地区等东部沿海地区已出现。对上述地区的高等教育发展，迫切需要有所超前的政策引导和支持。

　　弱化重点学校圈层结构，强化优势学科专业建设。各类重点学校与层级化的行政管理体制相互结合，形成了大小不一的重点学校圈层结构。这一结构严重影响高校公平竞争和多样化特色发展。弱化这一结构，关键要从两方面入手：一是实行高校分类指导。建立科学的高校分类体系，依据高校类型、目标定位、办学层次和办学水平，建立不同的政策导向和资源配置方式。二是强化优势学科专业建设，以一流学科建设助推一流大学建设。

　　改革财政拨款方式，实行基础拨款和专项拨款相结合。我国高等教育财政拨款主要采用“综合定额加专项补助”的方式。在实践中，这种拨款模式存在两方面的突出问题：一是财政拨款与高校定位脱节；二是大量分散且随机性的“专项资金”，难以对高校学科、科研特别是基础研究形成足够、持续和稳定的支持。解决上述问题，需要建立基于需求的基础拨款与基于绩效的专项拨款相结合的制度，既体现公平又提高效率。